根据土壤的性质施用不同的肥料和采用不同的施肥方法叫因土施肥，最基本的有效方法有以下三点：
1、土壤的保肥能力和供肥特点对施肥效果影响很大，凡是土壤比较粘重，有机质含量比较多，保肥力比较强，即使一次施肥较多，养分也不至于流失。反之，土壤属砂性，有机质含量较少，则保肥能力相应较弱，在这种土壤上施肥，每次用量不宜过多，应采用少量多次，以免养分流失而造成浪费。但土壤的供肥特点也各有不同，有的肥劲长而稳，这种土壤是饱得饿不得，一次施肥可多些，次数可少些，有前劲而后劲不足的早发田，应注意作物的后期施肥，有后劲而前劲不足的晚发田，应注意作物的后期施肥。
2、土壤中各种养分的多少，是决定该施哪种肥料、施多少的主要根据。土壤中的养分状况，不仅与土壤成土母质有关，还与前茬有着直接或间接的关系。一般来说如前茬是豆科作物或绿肥，在土壤中的氮就比较多，应该增施磷、钾肥，如前茬是禾本科作物（如水稻、小麦等）则土壤中养分消耗就比较多，应该增施氮、磷、钾，尤其是氮肥。
3、土壤的酸碱性会影响施肥的效果，而施用的化学肥料会影响土壤的酸碱性。酸性土壤应选择碱性肥料，如碳酸氢氨，钙镁磷肥等，碱性土壤应选择酸性肥料，如过磷酸钙、硫酸铵等，这样就可避免土壤变得过酸或过碱，又有利于作物对养分的吸收利用。